Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms