Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 MTCO3P42-201ENST00000509488 518 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 MTCO3P39-201ENST00000514812 518 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 KNTC1-206ENST00000534995 1065 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 SULT6B1-205ENST00000535679 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 PTMA-202ENST00000409115 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 LINC00458-202ENST00000427299 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 AC010203.1-201ENST00000548404 928 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 AC015818.2-201ENST00000563569 840 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 AC012467.1-201ENST00000607740 256 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 AL354696.1-201ENST00000614652 497 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 AC022306.3-201ENST00000619930 550 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 MAPK10-350ENST00000641777 965 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 NIFK-AS1-202ENST00000414554 1411 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 LIPK-201ENST00000404190 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 AC000124.1-201ENST00000448311 957 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 C2orf80-206ENST00000451346 979 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MKRN4PQ13434 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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