Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 PIP5K1A-204ENST00000409426 3737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 INTS6-201ENST00000311234 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 PIK3CG-205ENST00000496166 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC11.05□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 USP40-201ENST00000251722 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 MCRIP1-212ENST00000576730 2979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 KLC2-206ENST00000417856 3015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 DNM1-213ENST00000628346 3835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 FAM187A-201ENST00000331733 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 CCDC103-204ENST00000417826 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 RIMS1-218ENST00000522291 3876 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 MSH6-214ENST00000616033 3429 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 PNPLA8-206ENST00000436062 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 MAGED2-207ENST00000396224 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 AC012531.1-201ENST00000562848 2680 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 USP19-206ENST00000417901 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 DNAJC14-202ENST00000317287 2774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 PACSIN2-202ENST00000337959 3149 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC11.04□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 TUBGCP5-208ENST00000620435 3342 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 DGKZ-216ENST00000528615 2692 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms