Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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SP140Q13342 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SP140Q13342 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SP140Q13342 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SP140Q13342 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SP140Q13342 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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SP140Q13342 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SP140Q13342 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SP140Q13342 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SP140Q13342 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SP140Q13342 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SP140Q13342 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SP140Q13342 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
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SP140Q13342 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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SP140Q13342 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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SP140Q13342 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
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SP140Q13342 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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SP140Q13342 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SP140Q13342 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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SP140Q13342 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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SP140Q13342 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SP140Q13342 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SP140Q13342 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SP140Q13342 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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SP140Q13342 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SP140Q13342 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SP140Q13342 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SP140Q13342 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SP140Q13342 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SP140Q13342 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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SP140Q13342 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SP140Q13342 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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