Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SRSF6Q13247 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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