Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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