Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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GPS1Q13098 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
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GPS1Q13098 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
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GPS1Q13098 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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GPS1Q13098 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
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GPS1Q13098 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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GPS1Q13098 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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GPS1Q13098 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GPS1Q13098 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
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