Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
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