Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NFX1Q12986 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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