Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 UROS-201ENST00000368774 744 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 PRKAR2A-AS1-203ENST00000431705 592 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 SERBP1P2-201ENST00000436888 1164 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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