Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
GRIN2AQ12879 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
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