Protein–RNA interactions for Protein: Q12774

ARHGEF5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF5Q12774 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.2■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.31
ARHGEF5Q12774 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGEF5Q12774 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGEF5Q12774 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGEF5Q12774 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGEF5Q12774 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGEF5Q12774 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGEF5Q12774 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGEF5Q12774 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGEF5Q12774 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGEF5Q12774 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGEF5Q12774 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGEF5Q12774 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGEF5Q12774 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGEF5Q12774 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGEF5Q12774 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGEF5Q12774 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGEF5Q12774 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGEF5Q12774 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGEF5Q12774 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGEF5Q12774 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGEF5Q12774 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGEF5Q12774 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms