Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC9.21□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC9.21□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC9.21□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC9.21□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC9.21□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC9.21□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC9.21□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC9.21□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC9.21□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC9.21□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC9.21□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC9.21□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC9.21□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC9.21□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC9.21□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC9.21□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
LRP1Q07954 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms