Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.4 ms