Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GABPAQ06546 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms