Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms