Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIN1Q05586 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms