Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 UROS-201ENST00000368774 744 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 AC010504.1-201ENST00000591311 585 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 AC233280.19-201ENST00000633223 136 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 FAM192A-218ENST00000567439 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ERCC6Q03468 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ERCC6Q03468 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ERCC6Q03468 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ERCC6Q03468 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ERCC6Q03468 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ERCC6Q03468 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ERCC6Q03468 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERCC6Q03468 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERCC6Q03468 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.1 ms