Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms