Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
XPCQ01831 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
XPCQ01831 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
XPCQ01831 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
XPCQ01831 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
XPCQ01831 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
XPCQ01831 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
XPCQ01831 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
XPCQ01831 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
XPCQ01831 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
XPCQ01831 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
XPCQ01831 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
XPCQ01831 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
XPCQ01831 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
XPCQ01831 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
XPCQ01831 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
XPCQ01831 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
XPCQ01831 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
XPCQ01831 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
XPCQ01831 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
XPCQ01831 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
XPCQ01831 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
XPCQ01831 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
XPCQ01831 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
XPCQ01831 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
XPCQ01831 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
XPCQ01831 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
XPCQ01831 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
XPCQ01831 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
XPCQ01831 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
XPCQ01831 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
XPCQ01831 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
XPCQ01831 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
XPCQ01831 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
XPCQ01831 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
XPCQ01831 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
XPCQ01831 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
XPCQ01831 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
XPCQ01831 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
XPCQ01831 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
XPCQ01831 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
XPCQ01831 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
XPCQ01831 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
XPCQ01831 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
XPCQ01831 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
XPCQ01831 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
XPCQ01831 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
XPCQ01831 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
XPCQ01831 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
XPCQ01831 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
XPCQ01831 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
XPCQ01831 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
XPCQ01831 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
XPCQ01831 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
XPCQ01831 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
XPCQ01831 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
XPCQ01831 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
XPCQ01831 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
XPCQ01831 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
XPCQ01831 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
XPCQ01831 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
XPCQ01831 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
XPCQ01831 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
XPCQ01831 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
XPCQ01831 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
XPCQ01831 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
XPCQ01831 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
XPCQ01831 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
XPCQ01831 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
XPCQ01831 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
XPCQ01831 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
XPCQ01831 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
XPCQ01831 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
XPCQ01831 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
XPCQ01831 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
XPCQ01831 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
XPCQ01831 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
XPCQ01831 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
XPCQ01831 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
XPCQ01831 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
XPCQ01831 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
XPCQ01831 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
XPCQ01831 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
XPCQ01831 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
XPCQ01831 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
XPCQ01831 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
XPCQ01831 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
XPCQ01831 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
XPCQ01831 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
XPCQ01831 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
XPCQ01831 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
XPCQ01831 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
XPCQ01831 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
XPCQ01831 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
XPCQ01831 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
XPCQ01831 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
XPCQ01831 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
XPCQ01831 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
XPCQ01831 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
XPCQ01831 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms