Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HBBP68871 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HBBP68871 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HBBP68871 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HBBP68871 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HBBP68871 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HBBP68871 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HBBP68871 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HBBP68871 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HBBP68871 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HBBP68871 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HBBP68871 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HBBP68871 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HBBP68871 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HBBP68871 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HBBP68871 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
HBBP68871 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HBBP68871 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
HBBP68871 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HBBP68871 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HBBP68871 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HBBP68871 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HBBP68871 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HBBP68871 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HBBP68871 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HBBP68871 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HBBP68871 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HBBP68871 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HBBP68871 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HBBP68871 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HBBP68871 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HBBP68871 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
HBBP68871 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HBBP68871 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HBBP68871 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HBBP68871 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
HBBP68871 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HBBP68871 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HBBP68871 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HBBP68871 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HBBP68871 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HBBP68871 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HBBP68871 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HBBP68871 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HBBP68871 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HBBP68871 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HBBP68871 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HBBP68871 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HBBP68871 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HBBP68871 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
HBBP68871 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HBBP68871 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HBBP68871 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HBBP68871 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HBBP68871 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HBBP68871 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HBBP68871 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HBBP68871 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HBBP68871 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
HBBP68871 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HBBP68871 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HBBP68871 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HBBP68871 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HBBP68871 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HBBP68871 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HBBP68871 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HBBP68871 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HBBP68871 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HBBP68871 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HBBP68871 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HBBP68871 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HBBP68871 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HBBP68871 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HBBP68871 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HBBP68871 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HBBP68871 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HBBP68871 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HBBP68871 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HBBP68871 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HBBP68871 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HBBP68871 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HBBP68871 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HBBP68871 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HBBP68871 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HBBP68871 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HBBP68871 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HBBP68871 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HBBP68871 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HBBP68871 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
HBBP68871 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HBBP68871 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HBBP68871 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HBBP68871 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HBBP68871 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HBBP68871 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HBBP68871 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HBBP68871 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
HBBP68871 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HBBP68871 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HBBP68871 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms