Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP46P62068 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP46P62068 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP46P62068 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP46P62068 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP46P62068 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP46P62068 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP46P62068 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP46P62068 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP46P62068 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP46P62068 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP46P62068 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP46P62068 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP46P62068 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP46P62068 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP46P62068 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP46P62068 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP46P62068 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP46P62068 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP46P62068 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP46P62068 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP46P62068 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP46P62068 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP46P62068 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP46P62068 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP46P62068 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP46P62068 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP46P62068 LINC02281-201ENST00000549013 375 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP46P62068 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
USP46P62068 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP46P62068 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP46P62068 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP46P62068 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP46P62068 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP46P62068 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP46P62068 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP46P62068 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP46P62068 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP46P62068 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP46P62068 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP46P62068 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP46P62068 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP46P62068 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP46P62068 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP46P62068 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP46P62068 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP46P62068 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP46P62068 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP46P62068 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP46P62068 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP46P62068 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP46P62068 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP46P62068 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP46P62068 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP46P62068 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP46P62068 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP46P62068 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP46P62068 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP46P62068 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP46P62068 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP46P62068 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP46P62068 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP46P62068 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP46P62068 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP46P62068 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP46P62068 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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USP46P62068 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP46P62068 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP46P62068 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP46P62068 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP46P62068 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP46P62068 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
USP46P62068 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
USP46P62068 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
USP46P62068 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
USP46P62068 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
USP46P62068 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
USP46P62068 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
USP46P62068 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
USP46P62068 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
USP46P62068 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
USP46P62068 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP46P62068 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP46P62068 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP46P62068 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP46P62068 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP46P62068 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP46P62068 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP46P62068 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP46P62068 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP46P62068 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP46P62068 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP46P62068 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP46P62068 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP46P62068 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP46P62068 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP46P62068 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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