Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 PTPRK-204ENST00000368210 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 AL805961.2-201ENST00000642139 4817 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 ROBO1-212ENST00000618833 7492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 AL008727.1-201ENST00000564460 4728 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 EPB41L5-205ENST00000452780 6410 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 PRR26-201ENST00000381489 7250 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 EIF4G1-207ENST00000411531 4683 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 INF2-202ENST00000330634 7578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 YIPF6-201ENST00000374622 6134 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 SPTB-202ENST00000389720 6321 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 CACNA1G-225ENST00000512389 6837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 QSOX1-202ENST00000367602 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 MYO9B-206ENST00000595618 7623 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 IRAK1BP1-201ENST00000369940 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 HCFC1-202ENST00000369984 8375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 FAM155A-201ENST00000375915 8503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms