Protein–RNA interactions for Protein: P61421

ATP6V0D1, V-type proton ATPase subunit d 1, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V0D1P61421 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP6V0D1P61421 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP6V0D1P61421 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP6V0D1P61421 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP6V0D1P61421 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP6V0D1P61421 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP6V0D1P61421 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP6V0D1P61421 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP6V0D1P61421 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V0D1P61421 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V0D1P61421 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V0D1P61421 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V0D1P61421 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V0D1P61421 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V0D1P61421 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V0D1P61421 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V0D1P61421 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V0D1P61421 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V0D1P61421 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V0D1P61421 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V0D1P61421 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V0D1P61421 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V0D1P61421 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V0D1P61421 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V0D1P61421 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V0D1P61421 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V0D1P61421 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V0D1P61421 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V0D1P61421 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V0D1P61421 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V0D1P61421 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V0D1P61421 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V0D1P61421 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V0D1P61421 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V0D1P61421 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V0D1P61421 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V0D1P61421 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V0D1P61421 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V0D1P61421 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V0D1P61421 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V0D1P61421 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V0D1P61421 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V0D1P61421 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V0D1P61421 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V0D1P61421 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V0D1P61421 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V0D1P61421 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V0D1P61421 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V0D1P61421 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V0D1P61421 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V0D1P61421 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V0D1P61421 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V0D1P61421 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V0D1P61421 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V0D1P61421 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V0D1P61421 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V0D1P61421 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V0D1P61421 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V0D1P61421 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6V0D1P61421 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6V0D1P61421 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6V0D1P61421 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6V0D1P61421 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6V0D1P61421 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6V0D1P61421 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6V0D1P61421 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6V0D1P61421 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6V0D1P61421 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6V0D1P61421 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6V0D1P61421 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6V0D1P61421 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6V0D1P61421 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6V0D1P61421 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6V0D1P61421 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6V0D1P61421 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6V0D1P61421 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6V0D1P61421 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6V0D1P61421 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6V0D1P61421 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6V0D1P61421 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6V0D1P61421 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6V0D1P61421 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6V0D1P61421 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6V0D1P61421 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6V0D1P61421 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6V0D1P61421 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6V0D1P61421 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6V0D1P61421 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6V0D1P61421 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6V0D1P61421 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6V0D1P61421 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6V0D1P61421 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6V0D1P61421 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6V0D1P61421 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6V0D1P61421 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6V0D1P61421 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6V0D1P61421 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6V0D1P61421 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6V0D1P61421 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP6V0D1P61421 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms