Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RPS3AP61247 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RPS3AP61247 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RPS3AP61247 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RPS3AP61247 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
RPS3AP61247 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RPS3AP61247 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RPS3AP61247 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RPS3AP61247 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPS3AP61247 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RPS3AP61247 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RPS3AP61247 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RPS3AP61247 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPS3AP61247 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPS3AP61247 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RPS3AP61247 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPS3AP61247 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RPS3AP61247 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPS3AP61247 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RPS3AP61247 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPS3AP61247 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RPS3AP61247 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RPS3AP61247 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPS3AP61247 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RPS3AP61247 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPS3AP61247 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RPS3AP61247 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPS3AP61247 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPS3AP61247 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RPS3AP61247 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPS3AP61247 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPS3AP61247 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPS3AP61247 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RPS3AP61247 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RPS3AP61247 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPS3AP61247 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPS3AP61247 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPS3AP61247 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPS3AP61247 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPS3AP61247 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RPS3AP61247 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPS3AP61247 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RPS3AP61247 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RPS3AP61247 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RPS3AP61247 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RPS3AP61247 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPS3AP61247 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPS3AP61247 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPS3AP61247 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RPS3AP61247 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPS3AP61247 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
RPS3AP61247 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RPS3AP61247 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPS3AP61247 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
RPS3AP61247 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RPS3AP61247 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPS3AP61247 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RPS3AP61247 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RPS3AP61247 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RPS3AP61247 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RPS3AP61247 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPS3AP61247 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RPS3AP61247 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPS3AP61247 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPS3AP61247 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RPS3AP61247 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RPS3AP61247 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RPS3AP61247 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
RPS3AP61247 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPS3AP61247 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPS3AP61247 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RPS3AP61247 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPS3AP61247 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RPS3AP61247 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPS3AP61247 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPS3AP61247 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RPS3AP61247 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RPS3AP61247 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPS3AP61247 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPS3AP61247 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPS3AP61247 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.03■□□□□ -0
RPS3AP61247 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RPS3AP61247 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RPS3AP61247 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPS3AP61247 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPS3AP61247 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RPS3AP61247 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RPS3AP61247 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RPS3AP61247 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RPS3AP61247 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RPS3AP61247 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RPS3AP61247 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RPS3AP61247 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RPS3AP61247 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RPS3AP61247 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RPS3AP61247 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RPS3AP61247 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RPS3AP61247 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RPS3AP61247 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RPS3AP61247 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms