Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJA9P57773 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJA9P57773 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJA9P57773 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJA9P57773 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJA9P57773 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJA9P57773 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GJA9P57773 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJA9P57773 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJA9P57773 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJA9P57773 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJA9P57773 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJA9P57773 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJA9P57773 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJA9P57773 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJA9P57773 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJA9P57773 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJA9P57773 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJA9P57773 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJA9P57773 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJA9P57773 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJA9P57773 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GJA9P57773 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJA9P57773 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJA9P57773 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJA9P57773 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GJA9P57773 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJA9P57773 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJA9P57773 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GJA9P57773 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GJA9P57773 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GJA9P57773 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJA9P57773 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJA9P57773 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJA9P57773 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJA9P57773 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJA9P57773 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJA9P57773 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJA9P57773 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJA9P57773 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJA9P57773 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJA9P57773 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJA9P57773 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJA9P57773 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJA9P57773 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJA9P57773 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJA9P57773 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GJA9P57773 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GJA9P57773 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GJA9P57773 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GJA9P57773 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GJA9P57773 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GJA9P57773 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GJA9P57773 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GJA9P57773 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GJA9P57773 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GJA9P57773 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GJA9P57773 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GJA9P57773 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJA9P57773 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJA9P57773 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJA9P57773 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJA9P57773 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJA9P57773 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GJA9P57773 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJA9P57773 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJA9P57773 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJA9P57773 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJA9P57773 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJA9P57773 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJA9P57773 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GJA9P57773 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJA9P57773 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GJA9P57773 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJA9P57773 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GJA9P57773 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GJA9P57773 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJA9P57773 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJA9P57773 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJA9P57773 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJA9P57773 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJA9P57773 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJA9P57773 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJA9P57773 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJA9P57773 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJA9P57773 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJA9P57773 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJA9P57773 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJA9P57773 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJA9P57773 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJA9P57773 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJA9P57773 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJA9P57773 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJA9P57773 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJA9P57773 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJA9P57773 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GJA9P57773 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJA9P57773 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJA9P57773 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJA9P57773 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms