Protein–RNA interactions for Protein: P55060

CSE1L, Exportin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSE1LP55060 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CSE1LP55060 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CSE1LP55060 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CSE1LP55060 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSE1LP55060 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSE1LP55060 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSE1LP55060 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSE1LP55060 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSE1LP55060 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSE1LP55060 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CSE1LP55060 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSE1LP55060 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSE1LP55060 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CSE1LP55060 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSE1LP55060 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSE1LP55060 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSE1LP55060 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSE1LP55060 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSE1LP55060 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSE1LP55060 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSE1LP55060 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSE1LP55060 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSE1LP55060 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSE1LP55060 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSE1LP55060 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSE1LP55060 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSE1LP55060 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CSE1LP55060 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSE1LP55060 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSE1LP55060 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSE1LP55060 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSE1LP55060 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSE1LP55060 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSE1LP55060 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSE1LP55060 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSE1LP55060 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSE1LP55060 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSE1LP55060 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSE1LP55060 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSE1LP55060 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSE1LP55060 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSE1LP55060 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSE1LP55060 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CSE1LP55060 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CSE1LP55060 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSE1LP55060 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSE1LP55060 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSE1LP55060 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSE1LP55060 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSE1LP55060 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSE1LP55060 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSE1LP55060 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSE1LP55060 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSE1LP55060 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CSE1LP55060 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSE1LP55060 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSE1LP55060 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSE1LP55060 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSE1LP55060 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSE1LP55060 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSE1LP55060 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSE1LP55060 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSE1LP55060 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSE1LP55060 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSE1LP55060 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSE1LP55060 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSE1LP55060 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSE1LP55060 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSE1LP55060 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSE1LP55060 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSE1LP55060 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSE1LP55060 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSE1LP55060 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
CSE1LP55060 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSE1LP55060 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSE1LP55060 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSE1LP55060 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSE1LP55060 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSE1LP55060 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSE1LP55060 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSE1LP55060 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSE1LP55060 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CSE1LP55060 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSE1LP55060 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSE1LP55060 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSE1LP55060 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSE1LP55060 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSE1LP55060 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSE1LP55060 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSE1LP55060 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSE1LP55060 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CSE1LP55060 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSE1LP55060 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSE1LP55060 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSE1LP55060 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSE1LP55060 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CSE1LP55060 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSE1LP55060 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CSE1LP55060 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSE1LP55060 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms