Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB28P51157 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB28P51157 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB28P51157 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB28P51157 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB28P51157 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB28P51157 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB28P51157 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB28P51157 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB28P51157 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB28P51157 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB28P51157 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB28P51157 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB28P51157 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB28P51157 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB28P51157 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB28P51157 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB28P51157 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB28P51157 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB28P51157 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB28P51157 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB28P51157 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB28P51157 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB28P51157 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB28P51157 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB28P51157 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB28P51157 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB28P51157 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB28P51157 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB28P51157 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB28P51157 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB28P51157 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB28P51157 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB28P51157 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB28P51157 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB28P51157 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB28P51157 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB28P51157 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB28P51157 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB28P51157 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB28P51157 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB28P51157 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB28P51157 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB28P51157 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB28P51157 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB28P51157 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB28P51157 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB28P51157 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB28P51157 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB28P51157 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB28P51157 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB28P51157 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB28P51157 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB28P51157 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB28P51157 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB28P51157 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB28P51157 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB28P51157 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB28P51157 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB28P51157 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB28P51157 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB28P51157 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB28P51157 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB28P51157 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB28P51157 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB28P51157 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB28P51157 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB28P51157 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB28P51157 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB28P51157 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB28P51157 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB28P51157 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB28P51157 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB28P51157 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB28P51157 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB28P51157 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB28P51157 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB28P51157 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB28P51157 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB28P51157 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB28P51157 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB28P51157 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB28P51157 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB28P51157 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB28P51157 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB28P51157 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB28P51157 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB28P51157 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB28P51157 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB28P51157 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB28P51157 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB28P51157 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB28P51157 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB28P51157 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB28P51157 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB28P51157 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB28P51157 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB28P51157 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB28P51157 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB28P51157 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms