Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms