Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PIK3CBP42338 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PIK3CBP42338 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms