Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FDFT1P37268 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms