Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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HOXD12P35452 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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