Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GPC1P35052 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPC1P35052 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPC1P35052 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPC1P35052 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPC1P35052 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPC1P35052 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPC1P35052 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPC1P35052 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPC1P35052 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPC1P35052 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPC1P35052 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPC1P35052 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPC1P35052 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPC1P35052 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPC1P35052 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPC1P35052 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPC1P35052 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPC1P35052 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPC1P35052 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPC1P35052 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPC1P35052 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPC1P35052 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPC1P35052 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GPC1P35052 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPC1P35052 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPC1P35052 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GPC1P35052 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPC1P35052 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPC1P35052 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPC1P35052 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPC1P35052 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPC1P35052 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPC1P35052 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPC1P35052 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GPC1P35052 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPC1P35052 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPC1P35052 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPC1P35052 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPC1P35052 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPC1P35052 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GPC1P35052 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPC1P35052 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GPC1P35052 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GPC1P35052 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GPC1P35052 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPC1P35052 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPC1P35052 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GPC1P35052 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPC1P35052 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPC1P35052 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPC1P35052 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPC1P35052 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPC1P35052 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPC1P35052 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPC1P35052 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPC1P35052 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPC1P35052 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPC1P35052 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPC1P35052 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPC1P35052 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPC1P35052 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPC1P35052 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPC1P35052 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPC1P35052 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPC1P35052 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPC1P35052 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPC1P35052 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPC1P35052 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPC1P35052 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPC1P35052 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPC1P35052 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPC1P35052 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPC1P35052 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPC1P35052 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPC1P35052 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPC1P35052 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPC1P35052 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPC1P35052 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPC1P35052 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPC1P35052 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPC1P35052 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPC1P35052 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPC1P35052 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPC1P35052 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPC1P35052 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPC1P35052 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPC1P35052 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPC1P35052 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPC1P35052 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPC1P35052 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPC1P35052 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPC1P35052 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GPC1P35052 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GPC1P35052 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPC1P35052 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPC1P35052 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPC1P35052 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPC1P35052 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPC1P35052 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms