Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms