Protein–RNA interactions for Protein: P28749

RBL1, Retinoblastoma-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBL1P28749 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBL1P28749 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RBL1P28749 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBL1P28749 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBL1P28749 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBL1P28749 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBL1P28749 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBL1P28749 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBL1P28749 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBL1P28749 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBL1P28749 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBL1P28749 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBL1P28749 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBL1P28749 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBL1P28749 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBL1P28749 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBL1P28749 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RBL1P28749 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBL1P28749 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBL1P28749 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBL1P28749 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RBL1P28749 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBL1P28749 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBL1P28749 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBL1P28749 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBL1P28749 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBL1P28749 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBL1P28749 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBL1P28749 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBL1P28749 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBL1P28749 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBL1P28749 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBL1P28749 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBL1P28749 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBL1P28749 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBL1P28749 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBL1P28749 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBL1P28749 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBL1P28749 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RBL1P28749 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBL1P28749 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBL1P28749 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBL1P28749 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBL1P28749 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBL1P28749 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBL1P28749 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBL1P28749 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBL1P28749 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBL1P28749 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBL1P28749 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBL1P28749 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBL1P28749 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBL1P28749 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBL1P28749 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBL1P28749 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBL1P28749 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBL1P28749 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBL1P28749 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBL1P28749 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBL1P28749 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBL1P28749 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RBL1P28749 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBL1P28749 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBL1P28749 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBL1P28749 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RBL1P28749 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBL1P28749 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBL1P28749 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RBL1P28749 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBL1P28749 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBL1P28749 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBL1P28749 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBL1P28749 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBL1P28749 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBL1P28749 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBL1P28749 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBL1P28749 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBL1P28749 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBL1P28749 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBL1P28749 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBL1P28749 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBL1P28749 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBL1P28749 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBL1P28749 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBL1P28749 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBL1P28749 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBL1P28749 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBL1P28749 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBL1P28749 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBL1P28749 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBL1P28749 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBL1P28749 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBL1P28749 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBL1P28749 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBL1P28749 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBL1P28749 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RBL1P28749 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBL1P28749 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RBL1P28749 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBL1P28749 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms