Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SSFA2P28290 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SSFA2P28290 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SSFA2P28290 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SSFA2P28290 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SSFA2P28290 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SSFA2P28290 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SSFA2P28290 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SSFA2P28290 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSFA2P28290 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSFA2P28290 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSFA2P28290 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSFA2P28290 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSFA2P28290 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSFA2P28290 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSFA2P28290 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSFA2P28290 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSFA2P28290 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSFA2P28290 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSFA2P28290 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSFA2P28290 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSFA2P28290 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSFA2P28290 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SSFA2P28290 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SSFA2P28290 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSFA2P28290 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSFA2P28290 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSFA2P28290 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSFA2P28290 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SSFA2P28290 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SSFA2P28290 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSFA2P28290 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSFA2P28290 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSFA2P28290 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSFA2P28290 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSFA2P28290 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSFA2P28290 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSFA2P28290 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SSFA2P28290 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSFA2P28290 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSFA2P28290 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SSFA2P28290 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSFA2P28290 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSFA2P28290 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSFA2P28290 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSFA2P28290 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSFA2P28290 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSFA2P28290 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSFA2P28290 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSFA2P28290 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSFA2P28290 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSFA2P28290 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSFA2P28290 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSFA2P28290 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSFA2P28290 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSFA2P28290 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSFA2P28290 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSFA2P28290 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSFA2P28290 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSFA2P28290 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSFA2P28290 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSFA2P28290 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSFA2P28290 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSFA2P28290 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SSFA2P28290 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSFA2P28290 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSFA2P28290 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSFA2P28290 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSFA2P28290 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSFA2P28290 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSFA2P28290 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSFA2P28290 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSFA2P28290 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSFA2P28290 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSFA2P28290 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSFA2P28290 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SSFA2P28290 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSFA2P28290 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSFA2P28290 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSFA2P28290 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSFA2P28290 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSFA2P28290 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSFA2P28290 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSFA2P28290 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSFA2P28290 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSFA2P28290 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SSFA2P28290 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SSFA2P28290 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSFA2P28290 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSFA2P28290 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SSFA2P28290 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSFA2P28290 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSFA2P28290 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSFA2P28290 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSFA2P28290 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SSFA2P28290 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSFA2P28290 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSFA2P28290 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSFA2P28290 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSFA2P28290 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms