Protein–RNA interactions for Protein: P25054

APC, Adenomatous polyposis coli protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCP25054 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
APCP25054 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
APCP25054 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
APCP25054 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
APCP25054 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
APCP25054 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
APCP25054 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
APCP25054 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
APCP25054 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
APCP25054 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
APCP25054 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
APCP25054 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
APCP25054 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
APCP25054 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
APCP25054 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
APCP25054 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
APCP25054 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
APCP25054 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
APCP25054 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
APCP25054 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
APCP25054 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
APCP25054 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
APCP25054 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
APCP25054 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
APCP25054 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
APCP25054 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
APCP25054 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
APCP25054 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
APCP25054 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
APCP25054 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
APCP25054 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
APCP25054 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
APCP25054 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
APCP25054 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
APCP25054 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
APCP25054 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
APCP25054 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
APCP25054 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
APCP25054 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
APCP25054 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
APCP25054 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
APCP25054 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
APCP25054 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
APCP25054 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
APCP25054 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
APCP25054 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
APCP25054 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
APCP25054 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
APCP25054 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
APCP25054 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
APCP25054 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
APCP25054 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
APCP25054 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
APCP25054 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
APCP25054 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
APCP25054 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
APCP25054 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
APCP25054 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
APCP25054 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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APCP25054 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
APCP25054 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
APCP25054 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
APCP25054 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
APCP25054 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
APCP25054 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
APCP25054 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
APCP25054 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
APCP25054 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
APCP25054 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
APCP25054 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
APCP25054 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
APCP25054 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
APCP25054 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
APCP25054 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
APCP25054 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
APCP25054 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
APCP25054 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
APCP25054 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
APCP25054 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
APCP25054 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
APCP25054 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
APCP25054 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
APCP25054 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
APCP25054 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
APCP25054 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
APCP25054 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
APCP25054 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
APCP25054 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
APCP25054 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
APCP25054 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
APCP25054 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
APCP25054 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
APCP25054 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
APCP25054 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
APCP25054 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
APCP25054 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
APCP25054 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
APCP25054 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
APCP25054 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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