Protein–RNA interactions for Protein: P23025

XPA, DNA repair protein complementing XP-A cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPAP23025 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XPAP23025 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
XPAP23025 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
XPAP23025 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XPAP23025 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XPAP23025 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
XPAP23025 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
XPAP23025 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
XPAP23025 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XPAP23025 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
XPAP23025 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
XPAP23025 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
XPAP23025 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XPAP23025 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XPAP23025 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
XPAP23025 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XPAP23025 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
XPAP23025 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
XPAP23025 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XPAP23025 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XPAP23025 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XPAP23025 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XPAP23025 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
XPAP23025 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XPAP23025 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XPAP23025 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
XPAP23025 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XPAP23025 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XPAP23025 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XPAP23025 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XPAP23025 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
XPAP23025 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XPAP23025 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XPAP23025 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XPAP23025 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XPAP23025 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XPAP23025 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XPAP23025 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XPAP23025 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XPAP23025 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XPAP23025 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XPAP23025 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XPAP23025 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XPAP23025 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XPAP23025 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XPAP23025 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XPAP23025 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XPAP23025 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XPAP23025 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XPAP23025 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
XPAP23025 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XPAP23025 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XPAP23025 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XPAP23025 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XPAP23025 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
XPAP23025 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
XPAP23025 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
XPAP23025 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XPAP23025 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XPAP23025 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
XPAP23025 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
XPAP23025 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XPAP23025 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XPAP23025 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XPAP23025 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XPAP23025 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XPAP23025 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XPAP23025 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XPAP23025 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XPAP23025 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XPAP23025 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XPAP23025 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XPAP23025 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XPAP23025 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XPAP23025 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XPAP23025 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XPAP23025 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
XPAP23025 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XPAP23025 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XPAP23025 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XPAP23025 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XPAP23025 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
XPAP23025 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
XPAP23025 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
XPAP23025 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
XPAP23025 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
XPAP23025 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
XPAP23025 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
XPAP23025 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
XPAP23025 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
XPAP23025 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
XPAP23025 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
XPAP23025 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
XPAP23025 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
XPAP23025 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
XPAP23025 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
XPAP23025 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
XPAP23025 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
XPAP23025 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
XPAP23025 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms