Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRHP20396 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRHP20396 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRHP20396 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRHP20396 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRHP20396 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRHP20396 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRHP20396 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRHP20396 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRHP20396 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRHP20396 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRHP20396 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRHP20396 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRHP20396 C11orf1-202ENST00000528125 534 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRHP20396 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TRHP20396 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRHP20396 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRHP20396 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TRHP20396 IQSEC2-207ENST00000638583 722 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRHP20396 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRHP20396 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRHP20396 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRHP20396 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRHP20396 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRHP20396 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRHP20396 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRHP20396 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRHP20396 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRHP20396 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRHP20396 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRHP20396 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRHP20396 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRHP20396 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRHP20396 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRHP20396 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRHP20396 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRHP20396 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRHP20396 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRHP20396 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRHP20396 PHACTR1-203ENST00000379335 943 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRHP20396 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRHP20396 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRHP20396 AC087620.1-201ENST00000520037 447 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRHP20396 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRHP20396 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRHP20396 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRHP20396 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRHP20396 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRHP20396 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRHP20396 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRHP20396 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRHP20396 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRHP20396 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TRHP20396 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRHP20396 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRHP20396 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRHP20396 MRPS28-201ENST00000276585 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRHP20396 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRHP20396 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRHP20396 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRHP20396 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TRHP20396 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TRHP20396 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRHP20396 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRHP20396 DUT-207ENST00000559416 635 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRHP20396 TNFRSF12A-204ENST00000573001 648 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRHP20396 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TRHP20396 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TRHP20396 CADM1-221ENST00000612235 1042 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRHP20396 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRHP20396 AL512324.3-201ENST00000619383 882 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TRHP20396 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRHP20396 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRHP20396 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRHP20396 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRHP20396 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRHP20396 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRHP20396 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRHP20396 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRHP20396 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRHP20396 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRHP20396 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRHP20396 GTF2I-203ENST00000443166 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRHP20396 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TRHP20396 AC023906.1-201ENST00000486386 453 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TRHP20396 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRHP20396 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRHP20396 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRHP20396 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TRHP20396 LINC01670-203ENST00000624859 977 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRHP20396 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRHP20396 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRHP20396 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRHP20396 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRHP20396 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRHP20396 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRHP20396 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRHP20396 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRHP20396 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRHP20396 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms