Protein–RNA interactions for Protein: P19387

POLR2C, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2CP19387 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 218.7 ms