Protein–RNA interactions for Protein: P15328

FOLR1, Folate receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOLR1P15328 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOLR1P15328 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FOLR1P15328 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOLR1P15328 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOLR1P15328 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOLR1P15328 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOLR1P15328 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOLR1P15328 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOLR1P15328 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOLR1P15328 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOLR1P15328 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOLR1P15328 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FOLR1P15328 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FOLR1P15328 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FOLR1P15328 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FOLR1P15328 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOLR1P15328 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FOLR1P15328 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOLR1P15328 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOLR1P15328 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
FOLR1P15328 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FOLR1P15328 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FOLR1P15328 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOLR1P15328 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FOLR1P15328 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
FOLR1P15328 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
FOLR1P15328 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FOLR1P15328 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FOLR1P15328 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FOLR1P15328 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FOLR1P15328 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
FOLR1P15328 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
FOLR1P15328 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
FOLR1P15328 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
FOLR1P15328 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
FOLR1P15328 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FOLR1P15328 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOLR1P15328 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOLR1P15328 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
FOLR1P15328 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOLR1P15328 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOLR1P15328 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FOLR1P15328 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOLR1P15328 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOLR1P15328 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FOLR1P15328 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOLR1P15328 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOLR1P15328 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOLR1P15328 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FOLR1P15328 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOLR1P15328 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOLR1P15328 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOLR1P15328 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FOLR1P15328 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FOLR1P15328 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FOLR1P15328 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOLR1P15328 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FOLR1P15328 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FOLR1P15328 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOLR1P15328 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FOLR1P15328 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FOLR1P15328 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FOLR1P15328 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOLR1P15328 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOLR1P15328 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FOLR1P15328 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOLR1P15328 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FOLR1P15328 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOLR1P15328 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FOLR1P15328 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FOLR1P15328 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
FOLR1P15328 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOLR1P15328 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FOLR1P15328 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
FOLR1P15328 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
FOLR1P15328 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FOLR1P15328 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
FOLR1P15328 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FOLR1P15328 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOLR1P15328 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOLR1P15328 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FOLR1P15328 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOLR1P15328 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOLR1P15328 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOLR1P15328 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FOLR1P15328 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOLR1P15328 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FOLR1P15328 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOLR1P15328 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOLR1P15328 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOLR1P15328 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOLR1P15328 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
FOLR1P15328 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOLR1P15328 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOLR1P15328 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOLR1P15328 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FOLR1P15328 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOLR1P15328 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FOLR1P15328 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FOLR1P15328 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms