Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXD8P13378 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms