Protein–RNA interactions for Protein: P10914

IRF1, Interferon regulatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF1P10914 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF1P10914 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF1P10914 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF1P10914 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF1P10914 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF1P10914 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF1P10914 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF1P10914 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF1P10914 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF1P10914 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF1P10914 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF1P10914 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF1P10914 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF1P10914 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF1P10914 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF1P10914 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF1P10914 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF1P10914 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF1P10914 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF1P10914 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF1P10914 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF1P10914 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF1P10914 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF1P10914 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF1P10914 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF1P10914 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF1P10914 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF1P10914 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF1P10914 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF1P10914 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF1P10914 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF1P10914 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF1P10914 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF1P10914 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF1P10914 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF1P10914 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF1P10914 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF1P10914 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF1P10914 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF1P10914 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF1P10914 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF1P10914 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF1P10914 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF1P10914 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF1P10914 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF1P10914 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF1P10914 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF1P10914 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF1P10914 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF1P10914 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF1P10914 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF1P10914 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF1P10914 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF1P10914 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF1P10914 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF1P10914 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF1P10914 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF1P10914 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF1P10914 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF1P10914 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF1P10914 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF1P10914 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF1P10914 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF1P10914 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF1P10914 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF1P10914 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF1P10914 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF1P10914 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF1P10914 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF1P10914 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF1P10914 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF1P10914 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF1P10914 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF1P10914 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF1P10914 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF1P10914 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF1P10914 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF1P10914 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF1P10914 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF1P10914 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF1P10914 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRF1P10914 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRF1P10914 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRF1P10914 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRF1P10914 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
IRF1P10914 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
IRF1P10914 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRF1P10914 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRF1P10914 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRF1P10914 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRF1P10914 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRF1P10914 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRF1P10914 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRF1P10914 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRF1P10914 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRF1P10914 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRF1P10914 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRF1P10914 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRF1P10914 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRF1P10914 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms