Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHOP08100 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHOP08100 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHOP08100 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHOP08100 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHOP08100 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHOP08100 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHOP08100 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHOP08100 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHOP08100 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHOP08100 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHOP08100 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHOP08100 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHOP08100 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RHOP08100 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RHOP08100 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHOP08100 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RHOP08100 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
RHOP08100 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
RHOP08100 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
RHOP08100 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHOP08100 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHOP08100 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHOP08100 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHOP08100 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHOP08100 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHOP08100 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHOP08100 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHOP08100 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHOP08100 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHOP08100 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHOP08100 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHOP08100 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHOP08100 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHOP08100 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHOP08100 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RHOP08100 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHOP08100 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHOP08100 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHOP08100 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHOP08100 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHOP08100 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHOP08100 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHOP08100 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHOP08100 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RHOP08100 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHOP08100 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHOP08100 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHOP08100 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHOP08100 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHOP08100 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHOP08100 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHOP08100 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHOP08100 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHOP08100 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHOP08100 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHOP08100 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHOP08100 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHOP08100 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHOP08100 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHOP08100 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHOP08100 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RHOP08100 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHOP08100 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHOP08100 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHOP08100 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHOP08100 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RHOP08100 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHOP08100 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHOP08100 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHOP08100 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHOP08100 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHOP08100 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHOP08100 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHOP08100 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHOP08100 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHOP08100 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RHOP08100 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHOP08100 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHOP08100 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHOP08100 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHOP08100 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHOP08100 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHOP08100 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHOP08100 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHOP08100 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RHOP08100 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHOP08100 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHOP08100 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHOP08100 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHOP08100 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHOP08100 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHOP08100 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHOP08100 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHOP08100 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHOP08100 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RHOP08100 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOP08100 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOP08100 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHOP08100 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms