Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYBBP04839 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CYBBP04839 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CYBBP04839 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYBBP04839 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYBBP04839 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYBBP04839 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYBBP04839 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYBBP04839 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYBBP04839 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYBBP04839 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYBBP04839 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CYBBP04839 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYBBP04839 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYBBP04839 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYBBP04839 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYBBP04839 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYBBP04839 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYBBP04839 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CYBBP04839 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYBBP04839 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYBBP04839 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYBBP04839 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYBBP04839 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYBBP04839 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYBBP04839 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CYBBP04839 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYBBP04839 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CYBBP04839 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYBBP04839 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYBBP04839 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYBBP04839 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYBBP04839 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYBBP04839 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYBBP04839 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYBBP04839 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYBBP04839 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYBBP04839 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYBBP04839 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYBBP04839 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CYBBP04839 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CYBBP04839 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYBBP04839 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYBBP04839 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYBBP04839 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYBBP04839 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYBBP04839 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CYBBP04839 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYBBP04839 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYBBP04839 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYBBP04839 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYBBP04839 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYBBP04839 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYBBP04839 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYBBP04839 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYBBP04839 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYBBP04839 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYBBP04839 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CYBBP04839 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CYBBP04839 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYBBP04839 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYBBP04839 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYBBP04839 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYBBP04839 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYBBP04839 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYBBP04839 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYBBP04839 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYBBP04839 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYBBP04839 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYBBP04839 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYBBP04839 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYBBP04839 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYBBP04839 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYBBP04839 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYBBP04839 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYBBP04839 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYBBP04839 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYBBP04839 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYBBP04839 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYBBP04839 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYBBP04839 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYBBP04839 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CYBBP04839 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYBBP04839 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYBBP04839 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CYBBP04839 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYBBP04839 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYBBP04839 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYBBP04839 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYBBP04839 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CYBBP04839 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYBBP04839 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYBBP04839 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYBBP04839 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYBBP04839 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYBBP04839 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYBBP04839 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYBBP04839 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYBBP04839 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYBBP04839 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms