Protein–RNA interactions for Protein: O95873

C6orf47, Uncharacterized protein C6orf47, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf47O95873 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C6orf47O95873 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
C6orf47O95873 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
C6orf47O95873 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C6orf47O95873 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C6orf47O95873 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C6orf47O95873 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
C6orf47O95873 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
C6orf47O95873 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
C6orf47O95873 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C6orf47O95873 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C6orf47O95873 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
C6orf47O95873 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C6orf47O95873 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C6orf47O95873 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C6orf47O95873 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C6orf47O95873 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C6orf47O95873 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C6orf47O95873 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C6orf47O95873 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C6orf47O95873 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C6orf47O95873 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C6orf47O95873 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C6orf47O95873 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C6orf47O95873 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C6orf47O95873 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C6orf47O95873 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C6orf47O95873 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C6orf47O95873 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C6orf47O95873 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C6orf47O95873 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C6orf47O95873 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C6orf47O95873 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C6orf47O95873 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C6orf47O95873 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C6orf47O95873 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C6orf47O95873 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C6orf47O95873 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C6orf47O95873 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C6orf47O95873 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C6orf47O95873 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C6orf47O95873 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C6orf47O95873 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C6orf47O95873 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C6orf47O95873 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C6orf47O95873 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
C6orf47O95873 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C6orf47O95873 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C6orf47O95873 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C6orf47O95873 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C6orf47O95873 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C6orf47O95873 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C6orf47O95873 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C6orf47O95873 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
C6orf47O95873 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C6orf47O95873 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
C6orf47O95873 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C6orf47O95873 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C6orf47O95873 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C6orf47O95873 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
C6orf47O95873 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C6orf47O95873 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C6orf47O95873 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C6orf47O95873 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C6orf47O95873 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C6orf47O95873 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C6orf47O95873 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C6orf47O95873 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
C6orf47O95873 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C6orf47O95873 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C6orf47O95873 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C6orf47O95873 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C6orf47O95873 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C6orf47O95873 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C6orf47O95873 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C6orf47O95873 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C6orf47O95873 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C6orf47O95873 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C6orf47O95873 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C6orf47O95873 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C6orf47O95873 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C6orf47O95873 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C6orf47O95873 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C6orf47O95873 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C6orf47O95873 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C6orf47O95873 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C6orf47O95873 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C6orf47O95873 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C6orf47O95873 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C6orf47O95873 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C6orf47O95873 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
C6orf47O95873 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
C6orf47O95873 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
C6orf47O95873 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
C6orf47O95873 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C6orf47O95873 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C6orf47O95873 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C6orf47O95873 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C6orf47O95873 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C6orf47O95873 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms