Protein–RNA interactions for Protein: O75396

SEC22B, Vesicle-trafficking protein SEC22b, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22BO75396 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC22BO75396 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC22BO75396 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC22BO75396 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC22BO75396 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC22BO75396 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC22BO75396 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC22BO75396 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC22BO75396 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC22BO75396 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC22BO75396 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC22BO75396 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC22BO75396 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC22BO75396 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC22BO75396 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC22BO75396 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC22BO75396 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC22BO75396 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC22BO75396 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC22BO75396 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC22BO75396 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC22BO75396 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC22BO75396 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC22BO75396 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC22BO75396 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC22BO75396 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC22BO75396 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC22BO75396 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC22BO75396 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC22BO75396 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC22BO75396 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC22BO75396 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC22BO75396 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC22BO75396 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC22BO75396 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC22BO75396 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC22BO75396 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC22BO75396 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC22BO75396 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC22BO75396 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC22BO75396 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC22BO75396 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC22BO75396 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC22BO75396 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC22BO75396 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC22BO75396 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC22BO75396 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC22BO75396 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC22BO75396 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC22BO75396 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC22BO75396 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC22BO75396 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC22BO75396 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC22BO75396 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC22BO75396 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC22BO75396 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC22BO75396 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC22BO75396 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC22BO75396 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC22BO75396 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC22BO75396 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC22BO75396 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC22BO75396 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC22BO75396 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC22BO75396 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC22BO75396 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC22BO75396 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC22BO75396 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC22BO75396 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC22BO75396 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC22BO75396 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC22BO75396 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC22BO75396 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC22BO75396 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC22BO75396 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC22BO75396 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC22BO75396 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC22BO75396 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC22BO75396 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC22BO75396 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC22BO75396 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC22BO75396 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC22BO75396 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC22BO75396 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC22BO75396 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC22BO75396 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC22BO75396 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC22BO75396 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC22BO75396 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC22BO75396 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC22BO75396 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC22BO75396 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC22BO75396 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC22BO75396 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC22BO75396 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC22BO75396 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC22BO75396 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC22BO75396 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC22BO75396 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC22BO75396 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms