Protein–RNA interactions for Protein: O43711

TLX3, T-cell leukemia homeobox protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLX3O43711 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TLX3O43711 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TLX3O43711 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TLX3O43711 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TLX3O43711 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TLX3O43711 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TLX3O43711 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TLX3O43711 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TLX3O43711 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TLX3O43711 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TLX3O43711 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TLX3O43711 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TLX3O43711 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TLX3O43711 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TLX3O43711 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TLX3O43711 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TLX3O43711 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TLX3O43711 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TLX3O43711 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TLX3O43711 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TLX3O43711 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TLX3O43711 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TLX3O43711 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TLX3O43711 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TLX3O43711 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TLX3O43711 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TLX3O43711 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TLX3O43711 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TLX3O43711 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TLX3O43711 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TLX3O43711 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TLX3O43711 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TLX3O43711 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TLX3O43711 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TLX3O43711 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TLX3O43711 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TLX3O43711 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TLX3O43711 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TLX3O43711 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TLX3O43711 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TLX3O43711 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TLX3O43711 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TLX3O43711 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TLX3O43711 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TLX3O43711 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TLX3O43711 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TLX3O43711 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TLX3O43711 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TLX3O43711 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TLX3O43711 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TLX3O43711 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TLX3O43711 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TLX3O43711 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TLX3O43711 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TLX3O43711 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TLX3O43711 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TLX3O43711 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TLX3O43711 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TLX3O43711 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TLX3O43711 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TLX3O43711 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TLX3O43711 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TLX3O43711 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TLX3O43711 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TLX3O43711 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TLX3O43711 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TLX3O43711 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TLX3O43711 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TLX3O43711 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TLX3O43711 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TLX3O43711 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TLX3O43711 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TLX3O43711 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TLX3O43711 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TLX3O43711 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TLX3O43711 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TLX3O43711 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TLX3O43711 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TLX3O43711 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TLX3O43711 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TLX3O43711 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TLX3O43711 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TLX3O43711 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TLX3O43711 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TLX3O43711 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TLX3O43711 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TLX3O43711 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TLX3O43711 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TLX3O43711 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TLX3O43711 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TLX3O43711 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TLX3O43711 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TLX3O43711 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TLX3O43711 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TLX3O43711 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TLX3O43711 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TLX3O43711 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TLX3O43711 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TLX3O43711 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TLX3O43711 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms