Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms