Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms